Пинежский государственный природный заповедник был создан 20 августа 1974 года Постановлением Правительства РСФСР № 474.
Заповедник расположен в среднем течении реки Пинеги, притока Северной Двины, на территории Пинежского района Архангельской области.
Целью создания заповедника является охрана и изучение естественных процессов в северной тайге на Восточно-Европейской равнине, уникальных карстовых образований, их влияния на живую и неживую природу, исследование редких и занесенных в Красные книги видов растений и животных.
Площадь 51 522 га.